All'interno lungo la navata si aprono alcune cappelle: sull'altare di quella a sinistra del coro la statua lignea raffigurante la Vergine proveniente dalla cappella, ormai demolita, di S. Maria del Ponte. L'altare maggiore del 1754 è in marmo policromo; attribuita a Giuseppe Mattia Borgnis la pala della Crocifissione con i santi patroni. Dal 1653 in chiesa sono conservate le spoglie del martire romano Teofilo.