L'intérieur abrite une nef unique: le long des murs sud-ouest, dans le registre supérieur, apparaissent des fragments de fresques de scènes de la vie de Jean Baptiste ; sur la paroi opposée, quatre saints couronnés ; dans le registre inférieur, représentation figurée des 12 mois entrecoupée de panneaux peints en imitation marbre. L'artiste qui effectua ces fresques est connu sous le nom de Maître de Campione. Il fut influencé par la peinture lombarde de la première moitié du XIVe s. La ligne des ornements autour des fresques est légère et élégante, selon le style, devenu une école après le XIVe s., des Maîtres de Campione. Dans le choeur, transformé à l'époque baroque, et sous l'arc triomphal, les fresques sont d'Isidoro Bianchi (1634).