L'intérieur comprend une nef unique avec quatre chapelles latérales et un choeur rectangulaire surmonté d'une coupole octogonale. Il est décoré de nombreux stucs dans les chapelles (XVIIe s.) et de fresques (1627) dans le choeur. Le maître-autel date du XVIIIe s. Il est surmonté d'une peinture du XVIIe s. représentant la Crucifixion. Au-dessus de la porte de la sacristie, un précieux triptyque en marbre sculpté représente la Vierge et deux saints (XVe s. ? Rodari de Maroggia).
